Работа опубликована в Nature. Учёные сравнили микробиом двух народов, живущих на противоположных сторонах планеты: хадза из Танзании и цимане из Боливийской Амазонии.

Через тысячи километров обнаружились одни и те же бактерии

Цимане занимаются земледелием, охотой и собирательством, а хадза остаются одним из немногих современных народов с традиционным образом жизни охотников-собирателей.

Предки этих групп разделились десятки тысяч лет назад, поэтому исследователей удивило, насколько похожими оказались некоторые обитатели их кишечника.

У цимане обнаружили 1408 видов бактерий и архей. 1231 из них — 87,4% — встречался также у хадза.

Причём большинство этих общих микробов нельзя назвать типичными для современного городского жителя. 848 видов, или около 60%, сегодня редки либо вообще не обнаруживаются в микробиоме людей из индустриальных обществ.

Бактерии повторили маршрут древних людей

Одного совпадения видов было недостаточно. Теоретически похожие бактерии могли независимо попасть к хадза и цимане уже значительно позже.

Поэтому исследователи сравнили геномы сотен микробных видов и попытались определить, когда их линии начали расходиться.

Картина оказалась похожа на историю расселения самого Homo sapiens. Для многих бактерий разделение популяций происходило примерно в те периоды, когда разделялись и человеческие группы — при древних миграциях из Африки и последующем заселении других континентов.

Для микробов цимане и хадза медианная оценка времени последнего активного генетического обмена составила около 17 тысяч лет назад.

Это означает, что предки некоторых современных кишечных бактерий могли жить внутри человека ещё до заселения Америки и передаваться из поколения в поколение вместе с людьми.

Разумеется, речь не идёт об одних и тех же бактериях, проживших десятки тысяч лет. Сохранялись их эволюционные линии — подобно тому как современные люди наследуют генетические линии своих далёких предков.

Почему у современных людей эти бактерии исчезают

Именно здесь исследование становится особенно интересным. Многие древние микробные линии хорошо сохранились у хадза и цимане, но стали редкими у жителей Европы, Северной Америки и других индустриализированных регионов.

Почему именно — новая работа не устанавливает. Причин может быть несколько: изменение питания, уменьшение количества клетчатки, антибиотики, высокая санитария, особенности родов и вскармливания детей, а также меньший контакт с почвой, животными и окружающей средой.

Насколько сильно современная медицина способна менять микробиом, показывают и другие исследования. Например, ранее RidLife писал, что последствия приёма некоторых антибиотиков для кишечных бактерий могут сохраняться до восьми лет.

Потеряли ли мы что-то полезное — пока неизвестно

Самый очевидный вопрос — вредно ли исчезновение древних бактерий для здоровья.

Пока ответа нет. Учёные не утверждают, что микробиом хадза или цимане «лучше», а микробиом городского человека — «хуже». Неизвестно даже, какие из исчезающих видов действительно выполняют важные функции и можно ли связать их потерю с конкретными заболеваниями.

Но исследование показывает другое: кишечный микробиом человека имеет гораздо более древнюю историю, чем казалось. Сотни видов микроорганизмов сопровождали наши миграции на протяжении тысяч поколений. А за последние несколько столетий часть этого биологического наследства начала исчезать.